Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xirp1O70373 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms