Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AurkbO70126 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms