Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms