Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn5O54942 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn5O54942 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn5O54942 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn5O54942 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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