Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E2f6O54917 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E2f6O54917 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms