Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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