Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FxnO35943 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FxnO35943 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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FxnO35943 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FxnO35943 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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