Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih2O35089 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnih2O35089 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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