Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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H2-Q1O19441 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
H2-Q1O19441 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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H2-Q1O19441 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
H2-Q1O19441 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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