Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfra2O08842 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfra2O08842 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms