Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MsmbO08540 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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