Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm21310J3QQ23 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21310J3QQ23 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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