Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2035J3QP87 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2035J3QP87 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms