Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm21972J3QN38 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21972J3QN38 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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