Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm3336J3QMQ6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3336J3QMQ6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm3336J3QMQ6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3336J3QMQ6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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