Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6176J3QK59 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm6176J3QK59 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm6176J3QK59 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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