Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21060J3KMU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21060J3KMU4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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