Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zc3h12bG3X9I7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms