Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-M1F7CXU4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms