Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm10477F6SW83 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10477F6SW83 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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