Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm4450E9Q007 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm4450E9Q007 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm4450E9Q007 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm4450E9Q007 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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