Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ryr1E9PZQ0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms