Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms