Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syce3B5KM66 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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