Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap221A9Q751 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms