Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gm6880A3KG45 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm6880A3KG45 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm6880A3KG45 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm6880A3KG45 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm6880A3KG45 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm6880A3KG45 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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