Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pramef25A2ASI9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms