Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm2A2A7B5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms