Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r25W4VSP2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r25W4VSP2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms