Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3bQ9Z321 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms