Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gria4Q9Z2W8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gria4Q9Z2W8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms