Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ror1Q9Z139 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms