Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clip2Q9Z0H8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip2Q9Z0H8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms