Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AireQ9Z0E3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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