Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sema6cQ9WTM3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema6cQ9WTM3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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