Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trpc2Q9R244 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpc2Q9R244 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms