Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms