Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms