Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms