Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ubxn8Q9QZ49 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms