Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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