Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Kcnip3Q9QXT8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Kcnip3Q9QXT8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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