Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim44Q9QXA7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim44Q9QXA7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms