Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lsm4Q9QXA5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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