Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mid2Q9QUS6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mid2Q9QUS6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms