Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmod4Q9JLH8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmod4Q9JLH8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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