Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr5Q9JLF7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr5Q9JLF7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr5Q9JLF7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tlr5Q9JLF7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlr5Q9JLF7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms