Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scamp5Q9JKD3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms