Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn19Q9ET38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms