Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp29Q9ES63 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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